基于特异性组学和蛋白质组学的高海拔肺动脉高压大鼠模型的新靶点

食管高热（PH）是指表征时平均食管压≥25 mmHg。 它根据血流向力讲授特征、复发前提和病理讲授总称五类。 第三类极低纬度食管高热（HAPH）是由于在极低纬度栓塞环境中所肺换气量代偿性上升和肺小动脉血清素引致的，引致高原心肌病。 临床症状除此以外操纵性呼吸困难、头痛和疲乏。 HAPH 可能会总结了未能适应极低纬度，并伴有不清楚的病理生理前提。 大约有 1.4 亿人生活在海拔 2,500 米以上的沿海地区，每年有超过 4,000 万人回访这些极低纬度沿海地区。 栓塞引致肾脏表观对光发生不同推移； 这是从长期居住地在极低纬度沿海地区的当地人及其后代的突变型适应性推移中所得知的。HAPH 的疗程仍在科讲授研究中所。应建议病患者改在极低海拔沿海地区，氧疗有效性。用药疗程的科讲授研究仅限于一些随机测试。 HAPH 的病理与其他类型的 PH 相合像，因此值得考虑对 PAH 有效性的用药有否对 HAPH 有效性。

然而，所有这些特异性用药都在HAPH中所的有效性性和前提尚不清楚。为理解决这个难题，我们力图科讲授研究栓塞所关乎的原子前提，运用于啮齿类动物 HAPH 模型，并应用领域综合性除此以外讲授分析方法。 在此过程中所，我们力图科讲授研究几种特异性用药和复氧的主导作用，以确定极低纬度引致的栓塞的潜在新疗程靶点。 特别是，我们科讲授研究了特异性用药如何直接影响肾脏密切关系的不同突变和细胞内表达。

科讲授研究设计：

将啮齿类动物置于 10% O2（栓塞）过道中所 3 都于产生 PH。依此啮齿类动物（C 第三组）在整个实验者中所都处于常氧环境下，并在疗程期间（即从第 21 天开始）用小原子展开疗程。 3周时，其余啮齿类动物随机总称六第三组；一第三组被处死（第 21 天）以评量心血管系统。其余 5 第三组用特异性用药或复氧疗程，从第 21 天到第 35 天处死。慢性栓塞，小原子处理（M）；慢性栓塞，司来帕格疗程；慢性栓塞，奈尔替坦疗程；慢性栓塞，riociguat 疗程；慢性栓塞、复氧 (RE)。

mRNA第三组分析：

提炼总 RNA，并通过运用于 Arraystar rRNA Removal Kit 添加 rRNA 来富集 mRNA 和非字符 RNA。 mRNA 和非字符 RNA 被影片化苯甲酸组衍生物短影片（~200-500 nt）。以短影片为模板，利用随机六聚体引物衍生物第一酪氨酸键cDNA。在第二酪氨酸键衍生物过程中所，dTTP 被 dUTP 取代。 然后转入洗脱苯甲酸以通过末端修复和填充腺嘌呤来产物和分离短影片。 短影片被产物并与接头连结； 运用于尿嘧啶-N-脂质肽消化第二条酪氨酸键。 琼脂糖凝胶电泳后，选择最合适的影片作为模板展开PCR扩增。 运用于 Agilent 2100 生物分析仪和 ABI StepOnePlus 实时 PCR 该系统样本库展开定量和质量评量。 该文库运用于 Illumina HiSeq 2000 系统展开测序。

LC-MS/MS 分析

在连结到 Easy-nLC 1000 毛细管定量系统的Q Exactive HF 质对光仪上分析样本。将干燥的酪氨酸样本重新溶解在反应物 A（0.1% 吡啶水溶液）中所并加载到捕集柱中所运用于反应物 A 的最大压力为 280 bar，然后在；也的 150 μm × 30 cm 黏合剂微柱上以 5–35% 的局部展开分离流向相合 B（乙二醇和 0.1% 吡啶），流速为 600 nl/min，持续 150 分钟。 QE HF 的 MS 分析是在 3e6 离子的自动增益控制目标下展开一次全扫描，然后展开将近 30 次与资料相合关的 MS/MS 扫描具有更佳电磁场的冲撞解离，在 Orbitrap 中所检测到（R = 15,000 在 200 m/z）。

科讲授研究结果：

基于RNA-seq资料的共表达互联网的系统富集分析和门户原子深入科讲授研究。

基于细胞内资料的共表达互联网的系统富集分析和门户原子深入科讲授研究。

RNA-seq 和生物信息讲授揭示了对三种用药的反应密切关系的强相合关性，具有依然相合同的效果。GO 富集显示不同表达的突变除此以外参予激素适度、mRNA和译文的突变。

司来帕格、奈尔替坦和复氧可改善 HAPH。Serpina1、Cryz 和 Cmc1 被深入科讲授研究出来，通过除此以外讲授选取，作为参予HAPH的极其重要突变。这些推断出为 HAPH 的特异性用药前提缺少了新的看法。

科讲授研究事实：

Selexipag、macitentan 和复氧显着减弱了啮齿类动物 HAPH 模型，而 riociguat 的主导作用较弱。 不同表达的突变参予激素调控、mRNA和译文。 某些细胞内受到 HAPH 和疗程的直接影响。 我们运用于除此以外讲授分析方法选取了极其重要突变 Serpina1、Cryz 和 Cmc1。 这些推断出可能会有助于更容易地理解栓塞所关乎的原子前提，并可能会缺少新的疗程靶点。

文献出处：

Xu X, Li H, Wei Q, Li X, Shen Y, Guo G, Chen Y, He K, Liu C. Novel Targets in a High-Altitude Pulmonary Hypertension Rat Model Based on RNA-seq and Proteomics. Front Med (Lausanne). 2021 Nov 3;8:742436. doi: 10.3389/fmed.2021.742436. PMID: 34805208; PMCID: PMC8595261.